Ratio war1/wild type msn2-4/wild type war1 msn2-4/wild type war1 <0,6 >0,6 msn2/4 >0,6 <0,6 war1-msn2/4 >0,6 >0,6 <0,6 Hsp30 >0,6 >0,6 >0,6 Group No of Genes STREs % low pH % Sorbate % war1 4 0 0 1 25 2 50 msn2/4 35 12 34 17 49 7 20 war1-msn2/4 13 5 38 5 38 1 8 Hsp30 21 3 14 5 24 2 10 No category 27 5 19 9 33 2 7 Name SGD ID Process wt SDEV war SDEV msn2/4 SDEV war1 msn2/4 SDEV Ratio 1 Ratio 2 Ratio 3 "Coote et al.;" "Moskvina et al.;" "Causton et al.;" PDR12 YPL058C transport* 7,09 2,13 0,92 0,26 14,25 9,45 1,55 0,29 0,13 2,01 0,22 a TFB2 YPL122C transcription initiation from Pol II promoter* 3,18 1,33 1,03 0,18 4,16 0,86 0,32 1,31 FUN34 YNR002C transport* 2,60 0,58 1,02 0,05 0,39 a d ECM39 YNR030W protein amino acid glycosylation* 2,24 0,31 1,27 0,29 4,39 2,46 1,34 0,20 0,57 1,95 0,60 Name SGD ID Process wt SDEV war SDEV msn2/4 SDEV war1 msn2/4 SDEV Ratio 1 Ratio 2 Ratio 3 "Coote et al.;" "Moskvina et al.;" "Causton et al.;" SPI1 YER150W biological_process unknown 8,19 5,77 6,16 1,43 1,60 0,37 1,42 0,74 0,75 0,20 0,17 a d YHR087W YHR087W biological_process unknown 6,48 5,00 8,58 4,89 1,04 0,10 0,80 0,25 1,32 0,16 0,12 d DDR2 YOL053C-A response to stress 5,23 1,46 3,71 2,91 1,16 0,28 0,71 0,22 b HSP26 YBR072W response to stress* 5,22 4,89 7,56 1,63 2,25 2,79 0,89 0,39 1,45 0,43 0,17 a b d HXK1 YFR053C fructose metabolism 4,95 3,10 5,81 3,82 1,05 0,34 0,93 0,27 1,17 0,21 0,19 b d GRE3 YHR104W response to stress* 4,50 3,04 5,18 3,03 1,47 0,76 1,15 0,33 d PHM7 YOL084W biological_process unknown 4,43 3,48 2,99 2,56 1,66 0,15 1,03 0,38 0,67 0,37 0,23 CTT1 YGR088W response to stress 4,21 1,51 5,91 0,23 1,21 1,27 1,40 0,29 a b d YER067W YER067W biological_process unknown 4,13 0,22 4,16 2,28 0,85 0,38 1,01 0,21 d TFS1 YLR178C regulation of proteolysis and peptidolysis 4,10 1,91 2,52 1,97 1,29 0,67 1,50 0,50 0,61 0,31 0,36 b d ACH1 YBL015W acetate metabolism* 3,76 1,41 3,04 1,01 1,98 2,26 1,06 0,75 0,81 0,52 0,28 b ALD3 YMR169C response to stress* 3,61 3,14 2,65 3,45 0,93 0,51 0,74 0,26 a HXT6 YDR343C hexose transport 3,34 0,72 5,13 2,61 0,43 0,17 0,46 0,09 1,54 0,13 0,14 a YOR173W YOR173W biological_process unknown 3,27 2,84 4,75 2,12 0,80 0,43 1,45 0,24 b d CYC7 YEL039C electron transport 2,98 1,80 3,57 2,51 1,19 0,84 1,29 0,35 1,20 0,40 0,43 b d UGP1 YKL035W protein amino acid glycosylation* 2,94 1,28 2,11 2,46 1,07 0,21 0,95 0,22 0,72 0,36 0,32 HXT7 YDR342C hexose transport 2,87 0,31 1,96 2,37 0,47 0,16 0,55 0,08 0,68 0,16 0,19 a NCE103 YNL036W biological_process unknown 2,81 2,66 2,57 2,90 1,14 0,32 1,38 0,42 0,91 0,41 0,49 SSE2 YBR169C protein folding 2,81 1,79 1,81 1,65 1,48 1,22 0,65 0,53 d GPX1 YKL026C response to oxidative stress 2,45 2,16 1,67 2,17 1,00 0,27 0,68 0,41 b OSH2 YDL019C steroid biosynthesis 2,42 1,25 1,45 0,37 1,21 0,13 1,08 0,28 0,60 0,50 0,45 YFL030W YFL030W glyoxylate cycle 2,40 1,14 2,02 0,80 0,97 0,16 1,29 0,73 0,84 0,40 0,54 d GAT1 YFL021W transcription initiation from Pol II promoter* 2,30 1,27 1,89 1,31 0,94 0,35 0,73 0,11 0,82 0,41 0,32 YPL004C YPL004C biological_process unknown 2,27 0,66 2,54 1,42 1,35 0,37 1,24 0,26 1,12 0,60 0,55 b d MCR1 YKL150W response to oxidative stress* 2,26 1,20 1,49 0,93 1,15 0,56 0,66 0,51 a b d MSS11 YMR164C pseudohyphal growth* 2,24 2,05 3,34 0,67 0,73 0,33 0,83 0,17 1,49 0,32 0,37 HXT3 YDR345C hexose transport 2,22 0,24 1,81 0,77 0,63 0,18 0,49 0,12 0,81 0,28 0,22 YLR251W YLR251W biological_process unknown 2,17 0,63 1,58 0,35 1,25 0,38 1,28 0,66 0,73 0,58 0,59 d HXT4 YHR092C hexose transport 2,16 0,31 2,56 0,52 1,12 1,13 1,04 0,63 1,19 0,52 0,48 PMC1 YGL006W calcium ion transport* 2,07 0,77 1,92 0,79 1,20 0,49 1,10 0,57 0,93 0,58 0,53 d YPS6 YIR039C biological_process unknown 2,07 0,75 2,49 0,61 1,11 0,25 1,20 0,54 PDR15 YDR406W transport 2,06 0,48 1,80 0,36 0,64 0,32 0,56 0,16 0,87 0,31 0,27 d YGR043C YGR043C biological_process unknown 2,02 1,06 1,91 0,60 1,18 0,60 0,91 0,43 0,94 0,59 0,45 b YNR065C YNR065C biological_process unknown 2,01 0,23 1,67 0,46 1,01 0,29 0,83 0,50 TRS120 YDR407C ER to Golgi transport 1,86 0,36 2,23 0,18 0,85 0,32 1,20 0,46 Name SGD ID Process wt SDEV war SDEV msn2/4 SDEV war1 msn2/4 SDEV Ratio 1 Ratio 2 Ratio 3 "Coote et al.;" "Moskvina et al.;" "Causton et al.;" HSP30 YCR021C response to stress* 11,88 6,42 10,35 1,86 4,82 1,75 8,89 6,75 0,87 0,41 0,75 YER053C YER053C biological_process unknown 5,01 4,88 6,71 3,06 3,05 2,40 4,93 2,38 1,34 0,61 0,98 d YGP1 YNL160W response to stress* 4,48 0,92 5,00 1,97 4,92 2,92 6,75 2,95 1,12 1,10 1,51 YPC1 YBR183W ceramide metabolism 4,15 1,80 3,27 1,53 3,31 1,95 2,57 1,12 0,79 0,80 0,62 b d YRO2 YBR054W biological_process unknown 3,97 0,52 2,67 2,08 9,63 6,61 6,55 2,63 0,67 2,42 1,65 CIT1 YNR001C tricarboxylic acid cycle* 3,52 0,55 4,09 2,11 4,81 4,41 4,90 2,39 1,16 1,37 1,39 b YDR533C YDR533C biological_process unknown 3,07 0,55 2,31 1,77 2,04 1,12 2,39 0,79 0,75 0,67 0,78 a YBR053C YBR053C biological_process unknown 2,91 1,52 2,97 0,82 5,32 2,41 5,42 2,40 1,02 1,83 1,86 d ARO10 YDR380W leucine catabolism 2,61 2,09 2,20 2,12 5,46 3,83 5,21 2,57 0,85 2,09 2,00 SDH2 YLL041C tricarboxylic acid cycle* 2,46 0,89 1,58 0,50 1,93 1,09 1,58 0,81 0,64 0,78 0,64 YMR181C YMR181C biological_process unknown 2,37 1,73 1,78 0,23 1,75 0,74 2,49 1,12 0,75 0,74 1,05 b YPS1 YLR120C protein processing 2,17 0,75 1,89 1,00 3,00 0,85 2,85 0,38 0,87 1,38 1,31 YNL305C YNL305C biological_process unknown 2,11 0,14 2,01 0,12 1,53 0,44 1,72 0,38 0,95 0,72 0,81 TPO2 YGR138C polyamine transport 2,09 0,29 1,85 0,37 6,89 3,68 9,73 1,78 0,88 3,30 4,65 YDC1 YPL087W response to heat* 2,08 0,14 1,61 0,21 3,14 1,37 2,94 0,73 0,78 1,51 1,41 d PDC5 YLR134W pyruvate metabolism* 2,00 0,52 1,97 0,67 3,83 4,69 2,33 0,73 0,99 1,91 1,16 SFK1 YKL051W actin cytoskeleton organization and biogenesis* 2,00 0,30 1,37 0,27 3,26 1,04 5,25 1,68 0,69 1,63 2,63 BDH1 YAL060W butanediol fermentation 1,95 0,98 3,42 1,63 2,66 2,53 1,79 0,64 1,75 1,36 0,92 TIP1 YBR067C cell wall organization and biogenesis 1,91 0,25 2,18 0,21 1,53 0,63 2,37 0,83 1,14 0,80 1,24 a TPO4 YOR273C polyamine transport 1,91 1,28 1,62 0,53 1,73 0,71 2,43 1,04 0,85 0,90 1,27 d SDH4 YDR178W tricarboxylic acid cycle* 1,85 0,06 2,28 0,48 1,31 0,80 1,43 0,43 1,23 0,71 0,77 Name SGD ID Process wt SDEV war SDEV msn2/4 SDEV war1 msn2/4 SDEV Ratio 1 Ratio 2 Ratio 3 "Coote et al.;" "Moskvina et al.;" "Causton et al.;" GLK1 YCL040W carbohydrate metabolism 3,66 1,07 5,22 2,96 2,27 1,70 1,74 0,47 1,42 0,62 0,48 b d NCE102 YPR149W protein secretion 3,31 0,23 3,13 0,29 2,03 0,90 1,58 0,45 0,95 0,61 0,48 b YCL042W YCL042W biological_process unknown 2,83 0,88 2,82 0,25 2,44 2,10 1,22 0,63 1,00 0,86 0,43 ALD4 YOR374W ethanol metabolism 2,66 0,42 1,77 0,48 1,71 0,89 0,94 0,27 0,67 0,64 0,35 a b YNL335W YNL335W dubious ORF 2,46 0,78 2,47 1,06 1,55 1,47 1,01 0,63 TPS1 YBR126C response to stress* 2,32 0,84 2,76 0,80 1,42 0,73 1,17 0,24 1,19 0,61 0,50 b d RPA135 YPR010C transcription from Pol I promoter 2,30 1,69 3,16 1,52 2,30 1,13 1,08 0,52 1,37 1,00 0,47 YNL224C YNL224C biological_process unknown 2,16 1,15 1,98 1,22 1,90 0,50 1,25 0,66 0,92 0,88 0,58 YBR134W YBR134W dubious ORF 2,09 0,47 1,90 0,41 1,39 0,92 0,93 0,25 0,91 0,67 0,44 LSM4 YER112W nuclear mRNA splicing, via spliceosome* 2,08 0,43 1,78 0,31 2,06 1,40 0,74 1,01 0,86 0,99 0,35 YMR090W YMR090W biological_process unknown 2,06 0,55 1,73 0,57 1,51 0,80 0,88 0,39 0,84 0,73 0,43 d TPS3 YMR261C response to stress* 2,04 1,18 1,90 0,14 1,68 1,46 1,00 0,41 0,93 0,82 0,49 b d GPD1 YDL022W intracellular accumulation of glycerol 1,98 1,23 3,81 1,06 1,48 1,06 0,76 0,21 1,92 0,75 0,39 d RTN2 YDL204W biological_process unknown 5,55 2,77 3,16 2,23 1,08 0,69 0,57 0,19 a d CAK1 YFL029C protein amino acid phosphorylation* 3,95 1,72 2,15 1,28 1,01 0,33 1,01 0,29 0,55 0,26 0,26 YAL061W YAL061W biological_process unknown 3,78 2,67 2,04 0,95 1,94 0,95 0,83 0,92 0,54 0,51 0,22 b d YDL222C YDL222C cell wall organization and biogenesis 3,37 0,89 1,87 1,24 1,42 1,59 0,75 0,47 0,56 0,42 0,22 TPO1 YLL028W polyamine transport 3,25 1,81 1,81 0,79 4,92 1,64 3,48 0,96 0,56 1,51 1,07 ARO9 YHR137W aromatic amino acid family metabolism 2,87 0,64 10,26 3,49 6,54 1,93 3,57 2,28 GAD1 YMR250W response to oxidative stress* 2,80 1,12 1,85 0,93 1,06 0,70 0,66 0,38 d RAD9 YDR217C DNA repair* 2,65 1,24 1,55 0,66 1,29 0,69 1,46 0,67 0,58 0,49 0,55 YOR161C YOR161C biological_process unknown 2,61 0,53 1,43 1,36 0,91 0,59 0,58 0,11 0,55 0,35 0,22 d CBP2 YHL038C Group I intron splicing 2,57 2,36 0,91 0,13 0,36 YGR248W YGR248W biological_process unknown 2,50 1,58 1,81 0,97 0,72 d YKL036C YKL036C dubious ORF 2,40 1,29 1,64 1,24 0,69 HOT1 YMR172W regulation of transcription from Pol II promoter* 2,36 1,34 2,03 2,01 0,86 YOR052C YOR052C biological_process unknown 2,35 1,31 1,13 0,35 1,17 0,30 0,48 0,50 YJU2 YKL095W biological_process unknown 2,34 1,57 1,67 0,79 0,71 YNL194C YNL194C biological_process unknown 2,23 0,72 1,63 0,40 0,73 b YNL200C YNL200C biological_process unknown 2,18 0,41 1,21 0,17 1,51 0,55 0,55 0,69 d YOL048C YOL048C biological_process unknown 2,18 0,47 1,36 0,43 1,72 0,55 0,63 0,79 d OM45 YIL136W biological_process unknown 2,16 0,98 2,48 1,51 1,15 d YOL032W YOL032W biological_process unknown 2,14 1,66 1,19 0,32 1,12 0,29 0,56 0,52 SSA4 YER103W response to stress* 2,12 1,97 2,24 2,21 1,42 0,38 1,06 0,67 b d YBR116C YBR116C dubious ORF 1,99 0,47 3,50 3,12 1,66 0,94 1,76 0,83 a TPO3 YPR156C polyamine transport 1,84 0,65 3,33 4,32 4,51 3,81 1,81 2,45 YGR046W YGR046W biological_process unknown 1,84 1,00 1,11 0,08 2,18 2,14 0,60 1,19 YPL247C YPL247C biological_process unknown 1,83 0,53 2,42 0,91 1,33 b BAG7 YOR134W small GTPase mediated signal transduction 1,80 0,74 2,03 0,14 1,18 0,47 1,13 0,65 b YPR157W YPR157W biological_process unknown 1,80 0,63 1,52 0,71 4,72 3,47 0,85 2,62